Skip to content

各类分析工具 ​

基本属性 ​

(1)分子SMILES、各类 ID 、其他相关网站链接、(筛选的结果分子还会额外提供分子来源库); (2)展示分子物化属性, 如 MW、LogP 等; (3)提供 ADMET 属性预测。

FAQ: 对于虚拟筛选出的分子的 ADMET 性质的打分是怎么计算的呢?

平台对已知 ADMET 属性的分子信息进行学习并建立相应的 AI 预测模型,实现了基于图神经网络预测 ADMET 属性值。当一个新分子出现时,会通过模型进行打分,这些数值作为参考,可以在一定程度上体现出分子性质。

3D视图 ​

提供基于算法预测的结果分子优势构象(Top5)与靶标口袋结合的样式, 辅助您对结果分子进行评价、挑选。您也可以在此处下载不同构象的分子 .mol2 文件以及靶标 .pdb文件。

相互作用 ​

展示不同构象下, 配体分子与靶标口袋氨基酸位点产生的相互作用力。您可以借此判断配体的关键结构, 以实现进一步的优化。

结合位点 ​

展示配体分子不同构象与口袋中各个氨基酸位点结合情况统计, 以识别关键位点结合概率。您可以以此作为参考对配体进行选择。

合成路径 ​

平台中“” 与“” 模块提供完整的合成路径参考图。 其中每个原料分子均为可采购的分子砌块, 点击图中?图标可以查看合成对应的参考实例或反应模板。平台对砌块进行限价并控制反应步数, 控制方案成本。您可以参考平台提出的合成路径, 对结果分子的合成难易度进行评估。

结构示警 ​

根据已知的成药规则进行判断, 识别可能存在的毒性、风险结构。(请注意, 此处仅做为提示, 并不代表必然产生毒性或其他风险, 规则来源可见对应参考文献)

化学空间导航 ​

在化学空间中,每个点代表一个分子, 不同颜色的点对应不同类型分子(本次生成、历史生成、用户上传、参考分子等,具体可见界面图标)。其中的分子距离越近, 代表结构越相似, 分子颜色则越深, 则代表分子活性期望越高。您可以通过这种方式, 快速定位高活性区域, 确定具有高活性潜力的结构特征, 并在此基础上进一步迭代优化。每轮迭代结果, 都会丰富化学空间, 引导您一步步接近目标。

整体分布 ​

平台会对每次任务的结果分子进行汇总, 形成属性趋势分布图。其中, 参考分子对应的属性线默认绿色高亮, 在右侧选中任意结果分子时, 属性线也会对应红色高亮。 您也可以通过在图中框选属性区间, 对左侧分子进行快速过滤。

个体分布 ​

图中每个点代表一个分子, 横纵坐标轴均可以进行调整, 用户可以借此快速找到如:成药性好且活性高的分子;分子质量小且合成性好的分子等等。