各类分析工具
基本属性
(1)分子SMILES、各类 ID 、其他相关网站链接、(筛选的结果分子还会额外提供分子来源库); (2)展示分子物化属性, 如 MW、LogP 等; (3)提供 ADMET 属性预测。
FAQ: 对于虚拟筛选出的分子的 ADMET 性质的打分是怎么计算的呢?
平台对已知 ADMET 属性的分子信息进行学习并建立相应的 AI 预测模型,实现了基于图神经网络预测 ADMET 属性值。当一个新分子出现时,会通过模型进行打分,这些数值作为参考,可以在一定程度上体现出分子性质。
3D视图
提供基于算法预测的结果分子优势构象(Top5)与靶标口袋结合的样式, 辅助您对结果分子进行评价、挑选。您也可以在此处下载不同构象的分子 .mol2 文件以及靶标 .pdb文件。
相互作用
展示不同构象下, 配体分子与靶标口袋氨基酸位点产生的相互作用力。您可以借此判断配体的关键结构, 以实现进一步的优化。
结合位点
展示配体分子不同构象与口袋中各个氨基酸位点结合情况统计, 以识别关键位点结合概率。您可以以此作为参考对配体进行选择。
合成路径
平台中“” 与“” 模块提供完整的合成路径参考图。 其中每个原料分子均为可采购的分子砌块, 点击图中?图标可以查看合成对应的参考实例或反应模板。平台对砌块进行限价并控制反应步数, 控制方案成本。您可以参考平台提出的合成路径, 对结果分子的合成难易度进行评估。
结构示警
根据已知的成药规则进行判断, 识别可能存在的毒性、风险结构。(请注意, 此处仅做为提示, 并不代表必然产生毒性或其他风险, 规则来源可见对应参考文献)
化学空间导航
在化学空间中,每个点代表一个分子, 不同颜色的点对应不同类型分子(本次生成、历史生成、用户上传、参考分子等,具体可见界面图标)。其中的分子距离越近, 代表结构越相似, 分子颜色则越深, 则代表分子活性期望越高。您可以通过这种方式, 快速定位高活性区域, 确定具有高活性潜力的结构特征, 并在此基础上进一步迭代优化。每轮迭代结果, 都会丰富化学空间, 引导您一步步接近目标。
整体分布
平台会对每次任务的结果分子进行汇总, 形成属性趋势分布图。其中, 参考分子对应的属性线默认绿色高亮, 在右侧选中任意结果分子时, 属性线也会对应红色高亮。 您也可以通过在图中框选属性区间, 对左侧分子进行快速过滤。
个体分布
图中每个点代表一个分子, 横纵坐标轴均可以进行调整, 用户可以借此快速找到如:成药性好且活性高的分子;分子质量小且合成性好的分子等等。