靶标口袋库

「靶标口袋库」是本平台大部分 AI 任务的前置功能。通过建立一个靶标口袋，您可以对一个蛋白质的晶体结构（PDB 文件）进行非常精确的位置定义，供后续建立 AI 任务时选择使用。

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您可以在项目详情页点击相应卡片（如下图）；或在任意功能页面，点击侧边栏相应选项，进入该功能（具体可见：提高效率小妙招）。

点击右上角的 按钮，即可进入新建页面

您只需要通过几个简单的步骤，即可完成靶标档案的建立

• 第一步：选择实验操作对象： 您可以直接输入PDB ID 在后台数据库中检索标准 PDB 文件；也可以通过上传的方式提交当前系统未收录或经您自主调整后的 PDB 文件。上传完成后，您可以在右侧看到蛋白质三维样式以及 AI 预测的口袋位置。

• 第二步：设置操作对象名称 对当前选择的靶标蛋白进行命名，建议使用蛋白质名称；相关基因名称；PDB ID；Uniprot ID 等与本次研究相关的名称进行指代。

• 第三步：定义口袋位置 系统会自动为您预测口袋位置，并在左侧口袋列表中展示，预测的口袋以优先级排序，排名越靠前，代表算法认为其成药可能性越高。如果您对AI预测的口袋位置不满意，您可以选择自定义口袋,点击右上角 按钮，弹出相应操作窗口。 您可以通过点选页面中蛋白质氨基酸残基或下方序列的方式定义关键位点。点击 ，AI会自动补全口袋区域并生成完整的口袋文件。如果您对AI补全的口袋不满意，也可以随时进行调整，调整完毕后，点击 按钮，完成口袋自定义工作。

• 第四步：选取靶标口袋 为了保证后续工作具有指向性，您必须选择一个口袋位置作为当前档案的唯一口袋，若对多个口袋位置感兴趣，您需要分别建立相应档案。 此处下拉清单与右侧口袋列表一致，请对照选择。

• 第五步：命名靶标口袋档案 为当前档案进行命名，您可以在其他功能中通过该名称检索到当前档案。

• 第六步：建立靶标口袋档案 完成上述步骤后，点击 按钮，完成档案建立。

返回靶标发现与管理模块，即可看到历次建立的靶标档案。您可以在这里对其进行管理，包括查看、重命名、删除等工作。