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AI 分子生成

INFO

提供两种分子设计模式, 基于参考分子/无参考分子。前者结果更加收敛,保留部分学习参考分子特征;后者结果更加发散,提供更多活性结构。不论是哪种设计模式, 最终都将提供 AI 预测的完整的合成路径以供参考。


您可以在项目详情页点击相应卡片(如下图);或在任意功能页面, 点击侧边栏相应选项, 进入该功能(具体可见:提高效率小妙招)。

点击右上角的 按钮, 即可进入新建页面

通过以下几个步骤, 即可开展一个 AI 分子生成任务:

  • 第一步:选择靶标口袋档案 您需要从预先建立的靶标口袋文件中选择一个作为本次筛选的受体。如果您还没建立对应的档案, 请先前往靶标口袋发现与管理功能, 进行靶标档案的建立。

  • 第二步:选择主动设计模式 您可以选择完全由AI自主决策的无参考分子的设计模式;也可以选择输入参考分子, 进行定向生成。当前您可以通过输入小分子SMILES;读取历史收藏小分子记录;上传小分子文件或通过工具绘制参考分子结构的方式定义参考小分子。

  • 第三步:设置过滤参数 该步骤可跳过, 开启后可限制筛选分子的 MW;TPSA;LogP;HBA;HBD 等多项属性。

完成上述步骤后点击 按钮即可完成 AI 分子生成任务的建立。

返回 AI 分子生成功能的详情页面, 即可看到历次建立的任务。您可以在这里查看已完成任务详情, 或取消未完成的任务执行。

点击 按钮进入任务详情页面。

平台支持以下功能, 方便您进一步挑选、优化分子:

  • 查看分子详情 在这里我们为您提供分子属性、3D结合构象、配体-受体相互作用情况、结合位点分析、合成路径预测、风险结构示警等一系列功能, 帮助您对化合物进行评价。(更多相关信息请查看 各类分析工具) 此处重点关注合成路径, 其中所有原料分子均为可采购的分子砌块

  • 优化分子 您可以借助此功能或者尝试扩展活性结构, 实现骨架跃迁; 或者提高配体效率, 优化指定基团。 点击分子卡片上的 按钮, 可以选择不同方案进行优化。(具体优化方法可见相应模块介绍)