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AI 分子对接

INFO

您可以在这里对私有分子、配体虚筛结果分子、已收藏分子进行基于 AI 模型的 Docking 打分,预测结合构象, 分析结合位点。


新建任务

您可以在项目详情页点击相应卡片(如下图);或在任意功能页面, 点击侧边栏相应选项, 进入该功能(具体可见:提高效率小妙招)。

点击右上角的 按钮, 即可进入新建页面

通过以下几个步骤, 即可开展一个 AI 分子对接 任务:

  • 第一步:选择靶标口袋档案 您需要从预先建立的靶标口袋文件中选择一个作为本次筛选的受体。如果您还没建立对应的档案, 请先前往靶标口袋发现与管理功能, 进行靶标档案的建立。

  • 第二步:选取对接分子 您可以通过以下几种方式确定对接的配体清单。 (1)使用历史收藏记录中选择 (2)从配体虚筛结果中选择 (3)手工输入分子清单 选择后会在右侧展示对应的分子样式, 您可以任意选择所需要的配体进行对接打分

完成上述步骤后点击 按钮即可完成分子对接任务建立。

查看任务记录

返回分子对接功能的详情页面, 即可看到历次建立的任务。您可以在这里查看已完成任务详情, 或取消未完成的任务执行。

点击 按钮进入任务详情页面。

平台支持以下功能, 方便您进一步挑选、优化分子:

  • 查看分子详情 在这里我们为您提供分子属性预测、3D结合构象预测、配体-受体相互作用情况分析、结合位点分析、风险结构示警等一系列功能, 帮助您对化合物进行评价。(更多相关信息请查看 各类分析工具)

  • 优化分子 您可以借助此功能或者尝试扩展活性结构, 实现骨架跃迁; 或者提高配体效率, 优化指定基团。 点击分子卡片上的 按钮, 可以选择不同方案进行优化。(具体优化方法可见相应模块介绍)

FAQs

请问 AI 分子对接的综合结果「活性值」如何理解呢?「活性值」在什么范围内是较好的呢,是否有参考的数值呢?

结果中的「活性值」为模型算法预测的 IC50/EC50 值,数值越小代表活性期望越好。当然,系统给出的活性预期主要是作为参考,帮助您对结果进行挑选。与真实的湿实验结果相比较,预测结果通常有一定的偏差,甚至出现无活性的可能。因此,建议您在挑选过程中结合分子详情中的各项理化性质、小分子结合构象、关键位点作用概率等信息进行分析判断。